內容整理至 2026-10-20，實際以主管機關公告為準；個案請洽會計師或記帳士。
立法沿革與背景
立法理由
本條例前身為「生技新藥產業發展條例」（96 年施行），後於 110 年大幅修正並更名為「生技醫藥產業發展條例」，111 年 1 月 1 日起施行，施行期間至 121 年 12 月 31 日（共 10 年）。
制定目的：
- 促進臺灣生技醫藥產業發展，縮短新藥/新醫材從研發到上市的時間
- 提供租稅獎勵吸引資金投入高風險的生醫研發
- 擴大適用範圍：從原本僅限「新藥」，擴及**再生醫療、精準醫療、數位醫療、CDMO（委託開發暨製造）**等
與產業創新條例租稅優惠並列為我國最重要的產業租稅優惠法規，但本條例的優惠力度更大。
重點條文
第 5-6 條（適用範圍）
經中央目的事業主管機關認定之生技醫藥公司，從事以下業務可適用租稅優惠：
| 領域 | 內容 |
|---|---|
| 新藥 | 新成分新藥（NME/NCE）、新劑型/新療效/新使用途徑 |
| 高風險醫療器材 | 第三等級醫療器材 |
| 新興生技醫藥產品 | 再生醫療、精準醫療、數位醫療 |
| CDMO | 受託開發暨製造服務 |
| 動植物用藥品 | 新成分動植物用藥 |
第 7 條（研發投抵 — 公司）
| 項目 | 內容 |
|---|---|
| 投抵標的 | 投資於研究與發展支出 |
| 投抵率 | 當年度支出的 25% |
| 抵減上限 | 當年度應納營所稅額的 50% |
| 適用年限 | 支出年度起 5 年內抵減 |
實務重點
- 比產業創新條例租稅優惠的研發投抵（15%）更優惠
- 25% 投抵率 + 5 年抵減期 → 適合「前期大量投入、後期才有營收」的生技公司
- 須經科技部（現國科會）或衛福部審核認定為合格生技醫藥公司
- 研發支出須符合認定標準，不是所有支出都能算
第 8 條（個人股東投資抵減）
| 項目 | 內容 |
|---|---|
| 適用對象 | 以現金投資未上市櫃之生技醫藥公司，且持股達 3 年 |
| 投抵率 | 投資金額的 50% |
| 抵減上限 | 每年抵減金額不超過 500 萬元 |
| 抵減標的 | 個人綜合所得稅應納稅額 |
實務重點
- 這是臺灣所得稅制度中少數個人可直接投抵的優惠
- 持股需達 3 年 → 防止短期炒作
- 上限 500 萬元 = 投資 1,000 萬元即可用滿
- 天使投資人、創投合夥人最常使用此優惠
- 注意：產業創新條例租稅優惠第 23-1 條也有天使投資人條款，兩者可能擇一適用
第 9 條（技術股緩課所得稅）
生技醫藥公司以技術入股取得之股票，得選擇於轉讓時才課稅（緩課），非取得時即課。
實務重點
- 解決「紙上富貴先課稅」的問題 — 技術入股者取得股票時無現金，若立即課稅無力繳納
- 緩課期間不計入當年度所得
- 轉讓時按實際轉讓價格計算所得
案例
案例一：生技新藥公司的研發投抵
情境：甲生技公司（未上市）113 年度投入新藥研發支出 8,000 萬元，當年營所稅應納稅額 2,000 萬元。
計算：
- 研發投抵：8,000 萬 × 25% = 2,000 萬元
- 抵減上限：2,000 萬（應納稅額）× 50% = 1,000 萬元
- 113 年可抵減 1,000 萬元，剩餘 1,000 萬元可於未來 4 年內繼續抵減
- 實際繳稅：2,000 - 1,000 = 1,000 萬元
對比產創條例：若適用產創條例研發投抵（15%），僅能抵 8,000 萬 × 15% = 1,200 萬，且限當年度抵完
案例二：天使投資人的個人投資抵減
情境：李先生以現金 2,000 萬元投資乙生技公司（未上市櫃），持股滿 3 年。李先生年所得約 600 萬元，綜所稅應納稅額約 120 萬元。
計算：
- 投資抵減：2,000 萬 × 50% = 1,000 萬元
- 每年抵減上限：500 萬元
- 第 4 年可抵 120 萬元（全額抵減），第 5 年再抵 120 萬元...
- 理論上 1,000 萬元投抵額度可分多年用完
效果：李先生投資 2,000 萬元，可累計節稅最多 1,000 萬元（等於投資成本折半）
案例三：技術入股緩課的效果
情境：王博士以其開發的新藥專利技術入股丙生技公司，取得 500 萬股（每股面額 10 元，市價評估 30 元）。
比較：
| 方案 | 取得時課稅 | 轉讓時課稅（緩課） |
|---|---|---|
| 取得時所得 | 500 萬股 ×（30-10）= 1 億元 | 0 |
| 當年稅負 | 1 億 × 40% = 4,000 萬（邊際稅率） | 0 |
| 3 年後以每股 50 元賣出 | 另繳資本利得稅 | 500 萬股 ×（50-10）= 2 億元（課稅） |
結論：緩課讓王博士不必在「一毛現金都沒拿到」時先繳 4,000 萬稅
交叉參照
- 產業創新條例租稅優惠 — 一般產業研發投抵（15%），生技條例更優惠
- 所得稅法 — 營所稅及綜所稅基本規定
- 中小企業發展條例租稅優惠 — 中小企業研發投抵
- 運動產業發展條例 — 另一個有個人投資抵減的產業條例